Tras el reconocimiento público del resultado, el Gobierno decide convocar a un Gran Diálogo Nacional en donde sectores a favor y en contra del Acuerdo pudieran plantear sus propuestas de ajustes y precisiones al Acuerdo. En paralelo, las delegaciones en La Habana empezaban a procesar las propuestas remitidas por diferentes sectores sociales y construir un nuevo Acuerdo Final. Luego de más de 60 reuniones con representantes del «Sí» y del «No» en el plebiscito y tras varias semanas de trabajo en La Habana, el 12 de noviembre de 2016, Gobierno y FARC-EP anuncian haber llegado a un nuevo acuerdo.